随着冷藏集装箱制冷与控制技术的发展和日臻完善，进口冷藏集装箱适装货物范围不断拓展，包括温度从-60℃的超级冷冻鱼到30℃的花球茎，温度控制偏差要求小于1℃的温度敏感货物，采用湿度、空气结构控制或调节保鲜的水果和蔬菜等，保证将货物以最侍质量交付货主，延长上市保鲜期，提高经济效益。虽然冷藏集装箱现已具备多种完善地体质货物质量的功能，但货物正确的装箱前预处理，适当的包装和箱内堆装，特定的温度、湿度、新鲜空气换气量设置用空气结构控制或调节等都十分重要。如果做不好这些工作，将无法把货物保质保量地安全运抵目的地。
冷藏货物
进口冻畜禽肉类主要包括牛、羊、猪、鸡、鸭、鹅肉等，其主要营养成分有蛋白质、脂肪、糖类、无机盐和维生素等，由肌肉组织、脂肪组织、结缔组织和骨骼组织组成。
畜禽经屠宰后即成为无生命体，对外界的微生物侵害失去抗御能力，同时进行一系列的降解等生化反应，出现僵直、软化成熟、自溶和酸败等四个阶段。其中自溶阶段始于成熟后期，是质量开始下降的阶段。
冷冻贮藏是一种古老的、传统的保存易腐败货物的方法。货物由于酶的分解、氧化和微生物生长繁殖而失去使用价值，冷冻可以钝化酶的分解、减缓氧化、仰制微生物生长繁殖，使货物处于休眠状态，在产品生产数周甚至数月后仍保持原始质量消费。
通常肉类在-18℃以下即达到休眠状态，但-23℃以下的低温比-18℃的低温可成倍延长冷藏期，如附表1所示。在-30℃下的冷藏期比在-18℃下冻藏期长一倍以上，其中猪肉最明显。许多国家明确规定，冷冻食品、制成品和水产品必须在-18℃或更低的温度下运输。客户一般要求货物在运输期间温度保持在-18℃以下。
“镀冰衣”
进口巧克力要用非常清洁、无味的冷藏集装箱装载，并在适宜的温度下运输。低温有得于保证质量。托运人常常要求查对湿度设置在65%。根据不同品种的巧克力，温度通常设置在8℃～18℃之间。运输期间可能造成巧克力表面出现极小“花纹”的风险，颜色看起来有改变，并且影响质量。
危险和伤害货物
冷藏集装箱保持高标准运输危险或敏感货物并保持质量。这此专用冷箱用特殊颜色和标志区别。
温控货物
温控货物指这些货物在运输期间要求保持稳定的温度，像电影胶片、药品和食品，要避免结块和变质，其温度设置从-2℃～30℃之间。货物在装箱前应预冷到运输温度。
包装
包装是进口冷藏集装箱运输的重要组成部分，是防止货物损坏和污染的基础。适当的设计和高质量的包装材料应能承受冷冻和运输全过程。包装应能够:①防止货物积压损坏；②承受运输途中发生的冲击；③标准的外型尺寸适于货盘或直接装入冷箱；④防止货物脱水或减低水汽散失速度；⑤防止氧化的氧气障碍作用；⑥在低温和潮湿情况下保持强度；⑦防止串味；⑧经得住-30℃或更低的温度；⑨能支持堆放高度2.3米（7英尺10英寸）的货物。
冷藏货物拼箱混装
对低温深冷货物拼箱运输，除了制成食品与食品原料由于卫生情况及不同种类货物串味而受影响外，一般不存在其他重大影响。一般货物在比其推荐设置温度更低的温度下冻藏，更有利于保证质量。
箱内堆装
根据冷冻货物、保鲜货物、一般冷藏货物及危险品等特性的不同，在冷藏集装箱内的堆装方式也不同。
冷冻货物、一般冷藏货物及危险品等，由于货物自身不会发出热量，而且在装箱前已预冷到设定的运输温度，其堆装方法非常简单，仅需将货物紧密堆装成一个整体即可。在货物外包装之间、货物与箱壁之间不应留有空隙。但所装货物应低于红色装载线，只有这样，冷空气才能均匀地流过货物，保证货物达到要求的温度。
保鲜货物因有呼吸作用而产生二氧化碳、水汽、少量乙烯及其他微量气体和热量。堆装方式应当使冷空气能在包装材料和整个货物之间循环流动，带走因呼吸产生的气体和热量，补充新鲜空气。有以下两种标准装箱方式。